Postdoktor inom Polyploidsgenomik

Institutionen för ekologi och genetik utlyser en postdoktortjänst i Polyploidsgenomik, finansierat av VR, till programmet för Växtekologi och evolution.

Institutionen för ekologi och genetik, Uppsala Universitet. Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen.  Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare http://www.ieg.uu.se

Projektbeskrivning

Polyploidisering, ökningen av genomstorlek orsakad av nedärvning av ytterligare en uppsättning (eller uppsättningar) kromosomer är en stor kraft i evolutionen. Allopolyploidi motsvarar två processer som i grunden förändrar det ärftliga materialet: helgenomduplicering (WGD) och hybridisering. Övergång till allopolyploidi åtföljs också ofta av ett parningssystemskifte, från utkorsning till självbefrukning. Tre stora övergångar på en gång verkar ganska krävande. Ändå har våra senaste genomiska studier i naturliga lomme populationer (Capsella bursa-pastoris) såväl som med resyntetiserade allopolyploider, tillsammans med studier i andra allopolyploida arter, visat frånvaron av genomiska chocker. Istället finns det ett starkt föräldraarv och en gradvis utveckling av både alloploidi och självbefrukning -syndromet. Att förstå utvecklingen av dessa två övergångar innebär att förstå mer subtila processer, i synnerhet hur den genetiska arkitekturen hos kvantitativa egenskaper förändras av den gemensamma effekten av WGD, hybridisering och parningssystemskifte. Vi föreslår här (i) att dra nytta av de senaste framstegen i analysen av arkitekturen för komplexa egenskaper och genomföra genomomfattande associationsstudier (GWAS) i C. bursa-pastoris och dess diploida föräldraarter (ii) för att dra fördel av vår serie av omsyntetiserade Capsella polyploider för att korsa dessa omsyntetiserade polyploider med etablerade C. bursa-pastoris för att identifiera gener associerade med den progressiva utvecklingen av självbefrukning -syndromet.

Arbetsuppgifter

Fältarbete, laboratoriearbete (odling av växter och mätningar), bioinformatik, population- och kvantitativ genetisk analys.  Den sökande kommer att vara ansvarig för fältarbete, labbarbete, insamling av ny genomisk data och för dess bioinformatiska och populationsgenetiska analys, samt för att skriva och publicera artiklar.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom populationsgenomik eller evolutions biologi. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc. Kandidaten ska ha mycket bra förmåga att uttrycka sig på engelska, i såväl tal som skrift.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom god samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt

Färdighet i fältarbetet, labbarbete och relevanta programmeringsspråk (bash, Perl, Python, R), samt bra kunskap i statistik och modellering kommer att vara en stor fördel.

Om anställningen 

Tidsbegränsad anställning i 24 månader, med möjlighet till förlängning upp till max 36 månader, enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2024-07-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/. 

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Martin Lascoux, Martin.Lascoux@ebc.uu.se.

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill ha tjänsten och varför just du är lämplig för tjänsten, 2) ditt CV, 3) en kort beskrivning av din utbildning, 4) en kopia av din doktorsavhandling och dina betyg, 5) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-postadress och telefonnummer) 6) relevanta publikationer. Ansökan bör skrivas på engelska.

Välkommen med din ansökan senast den 15 maj 2024. UFV-PA 2024/1151

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.