Postdoktor i komparativ genomik

Uppsala Universitet

Publicerad: 2025-10-22   I  

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen.

Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare https://www.uu.se/institution/ekologi-och-genetik

Vi söker nu en postdoktor i komparativ genomik till programmet för Växtekologi och evolution.

Projektbeskrivning

Denna tjänst ingår i EU:s Horizon-projekt FruitDiv, som syftar till att övervaka, karakterisera, utnyttja och bevara mångfalden hos vilda släktingar till fruktträd (CWR). Projektet fokuserar särskilt på fem arter: äpplen, päron, plommon, mandlar och körsbär. Ett av projektets mål är att ge en jämförande bild av den genetiska mångfalden och populationsstrukturen hos CWR-arter. För detta ändamål har vi nyligen erhållit helgenomsekvenseringsdata (Illumina short-read pair-end) för över 250 individer av varje art som samlats in i naturliga populationer över deras utbredningsområden. Vi söker en postdoktorand som kan använda dessa data för att göra jämförande demografiska slutsatser för att i) förstå och jämföra CWR-arters demografiska historia, samt effekten av domesticering på dem, och ii) undersöka mönster av introgression mellan grödor och CWR. Projektet kommer främst att använda SNP, men vidare utveckling kan innefatta undersökning av strukturella variationer. Projektet leds gemensamt av Martin Lascoux och Pascal Milesi.

Arbetsuppgifter

Postdoktoranden kommer att analysera helgenomsekvenseringsdata från fem fruktträdsarter i ett jämförande sammanhang. Arbetets huvudsakliga innehåll kommer att bestå av populations- och kvantitativa genomikanalyser. Även om projektet i första hand är datorbaserat kan det även innefatta en mindre del fältarbete och/eller laboratoriearbete.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom Evolutionär biologi, populations- eller kvantitativ genomik eller relaterade områden. Examen ska vara uppfylld senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc. Den sökande ska ha tidigare erfarenhet av att arbeta med stora genomiska datamängder, både vad gäller antalet prover och antalet analyserade varianter.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom initiativförmåga, kreativt tänkande, förmåga att samarbeta och engagera sig i forskningsgruppernas och institutets verksamhet. Kandidaten ska ha mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska i såväl tal som i skrift.

Meriterande

Den sökande bör ha goda kunskaper om de grundläggande principerna inom evolutionsbiologi och en bakgrund inom populationsgenetik och genomisk, särskilt inom demografiska slutsatser. Dessutom bör den sökande ha en gedigen grund inom statistik. Följande färdigheter att ses även som meriterande: programmering, bioinformatik, matematik/modellering/statistik. Intresse för strukturell variantidentifiering är också en fördel. Observera att en bakgrund inom växtbiologi inte är obligatorisk, men ses som en fördel.

Om anställningen

Tidsbegränsad anställning i 24 månader, med möjlighet till förlängning upp till max 36 månader, enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-01-12 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av

Universitetslektor, Pascal Milesi, pascal.milesi@ebc.uu.se

Professor, Martin Lascoux, martin.lascoux@ebc.uu.se

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska innehålla 1) ett brev där du beskriver dig själv, dina forskningsintressen och varför du är intresserad av tjänsten, 2) ditt CV, inklusive namn och kontaktuppgifter till minst två referenser (e-postadresser och telefonnummer) och 3) en lista över relevanta publikationer. Ansökan bör skrivas på engelska.

Välkommen med din ansökan senast den 01 December 2025. UFV-PA 2025/3194

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se

Gå till platsbanken

Information

ARBETSGIVARE

Uppsala Universitet

ANTAL PLATSER

1 Platser

ANSÖKAN

Sista ansökningsdatum är:

2025-12-01

KONTAKTINFORMATION

Uppsala Universitet

Vi finns på

Anställningstyp

Tillsvidareanställning

Håll koll! Skapa egna jobbevakningar och få uppdateringar direkt till din mail

LÄS MER OM BEVAKNING